הרב מישאל ציון הוא חבר סגל בתוכנית מנדל למנהיגות בתרבות יהודית והיה מנהלה הראשון. הוא הוסמך לרבנות בישיבת "חובבי תורה" האורתודוקסית בניו יורק, ובוגר התוכנית לרבנות ישראלית של מכון הרטמן והמדרשה באורנים.
הוא למד ולימד במכון הרטמן בירושלים ובעבר שימש כמנהל שותף ורב תוכנית ״עמיתי ברונפמן.״ יחד עם אביו, נעם ציון, חיברו את הספר "הלילה הזה: הגדה ישראלית."
מישאל ציון הוא ממייסדי קהילת קלוזנר – מניין הלכתי שוויוני בירושלים.