שגית אייזנברג-מרדכי היא רואת חשבון ובעלת תואר ראשון ותואר שני במנהל עסקים מהמסלול האקדמאי במכללה למינהל שבראשון לציון.
ב-14 השנים האחרונות מילאה שורת תפקידי ניהול בסוכנות היהודית, כאשר בתפקידה האחרון ניהלה את אגף התקצוב הבקרה והכלכלה. במסגרת זו הובילה את תהליך גיבוש התקציב השנתי, ניהולו, גידור הסיכונים הכספיים וכן עסקה בהבניה הכספית והכלכלית של פרויקטים גדולים ויוזמות חדשות. לפני שעבדה בסוכנות היהודית שימשה כמנהלת צוותי ביקורת במשרד רו"ח "KPMG סומך חייקין".
אייזנברג-מרדכי גדלה בכפר אדומים, וכיום מתגוררת בירושלים עם בן זוגה רן ושלושת ילדיה.