פרופ' רון מרגולין הוא עמית מחקר במרכז קוגוד לחקר המחשבה היהודית ולהגות עכשווית במכון הרטמן. הוא פרופסור חבר בחוג לפילוסופיה יהודית ובתוכנית ה-M.A במדעי הדתות של אוניברסיטת תל אביב.
בעבר עמד מרגולין, יחד עם הרב ד"ר דניאל הרטמן, בראש התוכנית להתחדשות לימודי היהדות בבתי הספר התיכוניים הכלליים, לימים תוכנית "בארי" שבמכון הרטמן. בעשור האחרון עמד בראש תוכנית "אופקים" באוניברסיטת תל אביב להכשרת סטודנטים מצטיינים להוראת יהדות כתרבות בבתי הספר התיכוניים הכלליים.
למרגולין תואר ד"ר מהאוניברסיטה העברית בירושלים והוא מלמד חסידות, הגות יהודית מודרנית אתיקה והומניזם יהודי.
הוא כתב את הספר "מקדש אדם: ההפנמה הדתית ועיצוב חיי הדת הפנימיים בראשית החסידות" שיצא בהוצאת מגנס 2006; וכן את הספר "הדת הפנימית: פנומנולוגיה של חיי הדת הפנימיים והשתקפותם במקורות היהדות מן המקרא עד החסידות" שיצא לאור בשנת 2012 בהוצאת אוניברסיטת בר-אילן ומכון שלום הרטמן.
מרגולין היה מעורכי הספר "תהליכי חילון בתרבות היהודית" בשיתוף עם שמואל פיינר ואבריאל בר-לבב בהוצאת אוניברסיטת בר-אילן.
