גילי זיוון היתה חוקרת במרכז קוגוד במכון הרטמן.
עבודת הדוקטורט של גילי התפרסמה בספר "דת ללא אשליה" בהוצאת מכון הרטמן והפקולטה למשפטים באוניברסיטת בר-אילן, ועסקה בשאלות הנובעות מהמפגש בין אורתודוקסיה יהודית לבין עולם פוסט-מודרני.
גילי זיוון פועלת למען שילובן של נשים בחיים הדתיים, וכותבת בנושאים כמו אמונה בעידן של ספקות, דת ופלורליזם, אמונה נוכח שכול ואף בתחומים של יהדות ומגדר: קריאה פמיניסטית במקרא, פמיניזם אורתודוקסי וכיו"ב.