תוכנית לימודי התנ״ך היא עשירה, מגוונת וייחודית. במסגרתה נלמדים מגוון של ספרים וסוגים ספרותיים בתנ״ך. במהלך השנים נעסוק בפיתוח הרגישות לשאלות ראליות ולסוגיות אידאולוגיות במקרא ובפרשנות. בכל שנה נעמיק את צורת הדיון, נלמד שיטות שונות של פשט ודרש, ונעסוק בניתוח גישות אוניברסליות מול פרטיקולריות בתנ״ך בכלל, וכן בסוגיות הדנות בביטחון ב-ה׳ מול השתדלות אנושית. נושאים נוספים שנדון בהם באופן ממוקד יהיו דיני עזרה לחלש, דיני הנהגה, דיני מלחמה ושאלות ערכיות ומוסריות העולות מאלו.
בתיכון אנו מעודדים את תלמידנו (ורובם אכן עושים זאת) ללמוד תנ"ך ברמה של 5 יחידות בכיתות יא ויב. במסגרת התוכנית המוגברת, פותחו בתיכון נושא ״ קום והתהלך", במסגרתו נלמדות סוגיות הקשורות לגיאוגרפיה מקראית. ביחידה זו משולבים יותר מעשרה סיורי שטח המחברים בין הטופוגרפיה והממצאים הארכיאולוגיים לסיפורים ולסוגיות שנלמדו בכיתה. בנוסף, אנו מעמיקים ביחידה העוסקת "רש"י -רמב"ן", במסגרתה לומדים את הביוגרפיות של כל אחד מהפרשנים החשובים הללו, נקודות מרכזיות בפירושיהם ורעיונותיהם תוך קישור בין הסוגיות הללו לספר בראשית.
מידי שנה, כיתות י״ב עוסקות באופן מוגבר ב -"תורת הגמול" במקרא, המתמקד בספרים איוב, קהלת ותהלים, ובעזרתה דנים בנושאים שעלו בלימודי שואה ובמסע לפולין.